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네이버페이를 사용하는 사장님이라면 누구나 궁금해하는 수수료! 매년 바뀌는 정책 때문에 복잡하게 느껴지셨나요? 2025년 최신 기준에 맞춰 가맹점 등급별 수수료율, 갱신 주기, 그리고 놓치면 안 될 한시 지원 프로그램까지 한눈에 보기 쉽게 정리했습니다.
이 글 하나로 내 가게의 네이버페이 수수료를 정확히 파악하고 비용을 절약할 방법을 찾아보세요.
핵심 요약: 2025년 네이버페이 수수료, 이것만은 꼭!
- 가맹점 등급: 연매출에 따라 영세(≤3억)부터 일반(>30억)까지 5단계로 나뉘며, 매년 2회(2/14, 8/14) 자동 갱신됩니다.
- 수수료 차이: 쇼핑몰 유형에 따라 수수료 체계가 다릅니다. 자사몰은 ‘주문관리 수수료’, 독립몰 PG는 ‘결제수수료’, 오프라인 매장은 ‘예약주문관리 수수료’가 적용됩니다.
- 등급 반영 시점: 입점 첫날은 ‘일반’ 등급으로 보이지만, 다음 날부터 실제 등급이 적용되니 착오 없으시길 바랍니다.
- 특별 지원: 2025년 4월부터 7월까지, 신규 또는 휴면 복귀 영세·중소 가맹점을 대상으로 수수료를 100% 돌려주는 파격적인 지원이 있습니다. (9월 일괄 지급)
- 중요 변경사항: 2024년 5월 30일부터 네이버가 지원하는 ‘할인지원금’도 수수료 부과 기준 금액에 포함됩니다.
1. 내 수수료의 기준, 가맹점 등급과 갱신 주기
네이버페이 수수료는 국세청에 신고된 연매출을 기준으로 정해진 ‘가맹점 등급’에 따라 달라집니다.
가맹점 등급별 연매출 기준
| 등급 | 연매출 기준 |
|---|---|
| 영세 | 3억 원 이하 |
| 중소 1 | 3억 원 초과 ~ 5억 원 이하 |
| 중소 2 | 5억 원 초과 ~ 10억 원 이하 |
| 중소 3 | 10억 원 초과 ~ 30억 원 이하 |
| 일반 | 30억 원 초과 |
*위 표는 카드 우대 수수료 제도와 동일한 구조입니다.
등급 갱신은 언제 되나요?
- 정기 갱신일: 매년 2회, 2월 14일과 8월 14일에 국세청 매출 자료를 바탕으로 자동 업데이트됩니다.
- 신규 입점 시: 가입 첫날은 시스템상 ‘일반’ 등급으로 표시되지만, 다음 날부터 실제 매출 등급이 적용되니 걱정하지 않으셔도 됩니다.
💡 내 등급과 수수료율 확인하기
네이버페이센터 > 정산관리 > 나의 수수료 정보 메뉴에서 현재 적용되는 등급과 정확한 수수료율을 직접 확인할 수 있습니다.
2. 유형별 네이버페이 수수료 총정리 (VAT 포함)
내 쇼핑몰이 어디에 해당하는지 확인하고 수수료율을 비교해 보세요.
① 주문형 (자사몰, 호스팅몰)
가장 일반적인 형태로, 네이버페이가 결제뿐만 아니라 주문, 배송, CS 관리 기능까지 제공합니다.
- 신용카드: 1.87% (영세) ~ 3.74% (일반)
- 계좌이체: 1.65%
- 가상계좌: 1% (최대 275원)
- 휴대폰 소액결제: 3.85%
- 네이버페이 포인트/후불결제: 3.74%
② 결제형 (독립몰 PG)
네이버의 주문 관리 기능 없이 오직 결제 기능(PG)만 연동해 사용하는 형태입니다.
- 신용카드: 0.99% (영세) ~ 2.75% (일반)
- 결제 기능만 제공하므로 ‘주문관리 수수료’가 아닌 ‘결제수수료’가 부과되어 상대적으로 저렴합니다. 자세한 내용은 결제형 수수료 안내를 참고하세요.
③ 예약형 (네이버 예약, 매장 방문)
네이버 예약을 통해 결제가 발생하는 미용실, 식당 등 오프라인 매장에 적용됩니다.
- 일반 예약 (카드): 1.98% (영세) ~ 3.19% (일반)
- 네이버주문/매장방문 (카드): 0.88% (영세) ~ 3.19% (일반)
- 해외카드 결제: 3.85% (등급 무관)
- 단, 2025년까지는 프로모션을 통해 국내 카드와 동일한 등급별 수수료가 적용됩니다.
3. 놓치면 손해! 2025년 한시 지원 프로그램
네이버페이가 영세·중소 사업자를 위해 2025년 특별 지원 프로그램을 진행합니다. 아래 요건에 해당한다면 꼭 혜택을 챙기세요!
- ✅ 지원 대상
- 주문형/결제형 서비스에 신규 가입한 영세·중소 가맹점
- 최근 1년간(’24.4~’25.3) 결제 이력이 없었던 휴면 복귀 영세·중소 가맹점
- ✅ 지원 기간
- 2025년 4월 1일 ~ 7월 31일
- ✅ 지원 내용
- 위 기간 동안 발생한 결제수수료와 주문관리 수수료 100% 페이백
- ✅ 지급 시기
- 2025년 9월 중 판매자 충전금으로 일괄 지급
자세한 내용은 네이버페이 공식 안내에서 확인하실 수 있습니다.
4. 자주 묻는 질문 (FAQ)
사장님들이 가장 헷갈려 하는 부분을 모았습니다.
Q1. 네이버페이 수수료는 PG사 수수료와 이중으로 부과되나요?
아닙니다. 이중 부과가 아닙니다.
- 주문형의 ‘주문관리 수수료’는 결제, 주문, CS 인프라를 모두 포함한 비용으로, 별도 PG 수수료가 없습니다.
- 결제형의 ‘결제수수료’는 PG사 수수료와 같은 성격의 비용으로, 주문관리 수수료가 부과되지 않습니다.
Q2. 부분 취소나 환불 시 수수료는 어떻게 계산되나요?
환불 시에도 수수료는 최초 주문 시점의 수수료율을 기준으로 계산됩니다.
- 예시: 5만 원 결제 후 2만 원을 부분 취소하면, 남은 3만 원에 대해 최초 주문 시 적용됐던 수수료율로 다시 계산하여 정산합니다. 전액 환불 시에는 수수료도 전액 상계 처리됩니다.
Q3. 네이버 ‘할인지원금’도 수수료 부과 대상인가요?
네, 2024년 5월 30일부터 구매자가 실제 결제한 금액과 네이버가 지원한 할인금을 합산한 금액을 기준으로 수수료가 부과됩니다.
Q4. 영세·중소 사업자 우대 수수료는 왜 연 2회 바뀌나요?
이는 여신전문금융업법 및 정부 고시에 따라 영세·중소 가맹점의 부담을 덜어주기 위한 정책으로, 매년 2회 국세청 매출 자료를 기준으로 대상자를 선정하여 우대 수수료율을 적용하기 때문입니다.
마무리하며
네이버페이 수수료는 가맹점 등급과 쇼핑몰 유형에 따라 달라지는 다소 복잡한 구조를 가지고 있습니다. 하지만 오늘 정리해 드린 내용을 바탕으로 내 가게의 등급과 유형을 정확히 파악하고, 2025년 한시 지원 프로그램과 같은 혜택을 놓치지 않는다면 충분히 비용을 관리할 수 있습니다.
정확한 최종 수수료는 항상 네이버페이센터 > 정산관리 > 나의 수수료 정보에서 확인하는 습관을 들이는 것을 추천합니다.
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